Q. 私の文法書には nerede も neresi も「どこですか」となっています。用法や意味の上で一体どんな違いがあるんでしょうか。

A. ~ nerede? は位置・居場所を尋ねるのに用いられ「~はどこにありますか」「~はどこにいますか」と訳されることもあります。nerede の de は位置を表すデ格語尾です。
 Eviniz nerede? (あなたの)家はどこですか/どこにありますか?
 Fatma Hanım nerede? ファトマさんはどこですか/どこにいますか?

一方 ~ neresi? はよく地名を尋ねるのに用いられ「~は何というところですか」と訳すこともできます。neresi の si は限定語尾です。
 Burası neresi? ここはどこですか/何というところですか?
 Türkiye'nin başkenti neresi? トルコの首都はどこですか/何というところですか?

参考
 ニューエクスプレストルコ語 p.83, p.105

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